Antikörper konjugiert mit IRDye800 Fluorophoren wurden speziell für Proteindetektion im nahen Infrarotbereich (IR) entwickelt. Sie können im Western Blotting und anderen Anwendungen benutzt werden, wie beispielsweise in der Immunfluoreszenzmikroskopie unter Verwendung von 780nm/820nm Anregungs- und Emissionsfilter. Sehr schwache Hintergrundsignale sorgen für einen hohen Rauschabstand. Im Western Blot beispielsweise liegt die Nachweisgrenze im Pikogrammbereich. Beispiele für sekundäre Antikörper die mit IRDye800 konjugiert sind, sind goat anti-chicken IgG, donkey anti-goat IgG und rabbit anti-goat Antikörper sowie viele andere bei antikoerper-online erhältliche sekundäre Antikörper.

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